按其物質狀態分為半固體培養基和液體培養基和固體培養基三類；按其來源分為合成培養基和天然培養基。
固體培養基能形成單菌落，用于單克隆菌株篩選，比如轉化，劃線等等
液體培養基是用于不需要挑選單克隆的大規模養菌
頂層瓊脂的瓊脂含量通常只有固體培養基的一半
是用來做病毒噬菌斑用的
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